Pode sempre seguir carreira numa especialidade em que não especifique a licenciatura, ou a engenharia, nesse caso estaria no mesmo patamar dos outros candidatos, mas em relação a fazer trabalho de "engenharia civil" na FAP esqueça, é tal como disseram, a FAP já possui engenheiros proprios para esse efeito, talvez posssa concorrer a TMI? Acho que ainda existe, No fundo são os oficiais dos sargentos e praças CMI e de civis (carpinteiros, canalizadores, etc) que tratam de reparações quotidianas nas bases.
O melhor mesmo é perguntar a quem sabe, lembrei-me agora de um oficial RC (não me lembro agora é da especialidade ao certo) mas na prática trabalhava como oficial de CMI, e tinha a licenciatura de arquitectura, por isso se tiver certos conhecimentos pode ser que sejam mais ou menos bem aproveitados pela Força Aérea.